2012年2月10日，南沙首家通過整合社會資源興辦的創新創業孵化基地舉行了揭牌儀式，儀式上，孵化基地與廣州市激光技術應用研究所有限公司、國家醫療保健器具工程研究中心和國家醫療保健器具工程技術研究中心簽訂了合作協議。
南沙創新創業孵化基地，是南沙區首家通過整合社會資源投資興辦的科技企業孵化器，以南沙區科技創新綜合服務平臺為支撐，一方面聚集了廣州中國科學院工業技術研究院、廣州中國科學院沈陽自動化研究所分所、廣州中國科學院先進技術研究所、廣州中國科學院軟件應用技術研究所、廣州市香港科大霍英東研究院、廣州現代產業技術研究院、廣州南沙中山大學科技創新產業基地、廣州中船龍穴造船有限公司技術中心等雄厚的技術力量和科研成果為企業提供強大的技術支持；另一方面廣州南沙資訊科技園、辰光科技工業園、廣州南沙經濟技術開發區全國高新技術產業化中試配套基地、南沙高技能實訓鑒定基地服務有限公司等為企事業單位的研究成果提供轉化和產業化平臺。
該孵化基地首期提供孵化場地5200平方米，提供孵化種子資金300萬元。2012年計劃在孵企業30家，提供就業崗位200個。2013年進一步擴大孵化面積，在孵企業40家，畢業和在孵企業提供就業崗位600個，成為市級科技企業孵化器。
目前，孵化基地已有多個高科技項目入駐，主要集中于生物醫藥、電子信息、激光技術等領域，爭取通過3至5年努力，提供孵化場地兩萬平方米，在孵企業達到80家以上，畢業和在孵企業提供就業崗位1200個，成為國家級科技企業孵化器，將南沙創新創業孵化基地打造成為科技創新核心區、高端現代服務業的聚集區、知識產權的移轉區。
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